Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
4930504O13RikQ8C5Z9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930504O13RikQ8C5Z9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
4930504O13RikQ8C5Z9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930504O13RikQ8C5Z9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms