Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trerf1Q8BXJ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trerf1Q8BXJ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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