Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm4aQ8BW72 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4aQ8BW72 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4aQ8BW72 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms