Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Pggt1bQ8BUY9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pggt1bQ8BUY9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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