Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6kb1Q8BSK8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6kb1Q8BSK8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rps6kb1Q8BSK8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rps6kb1Q8BSK8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6kb1Q8BSK8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms