Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcaf1Q8BNE1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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Tcaf1Q8BNE1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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Tcaf1Q8BNE1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
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Tcaf1Q8BNE1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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Tcaf1Q8BNE1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcaf1Q8BNE1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Tcaf1Q8BNE1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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Tcaf1Q8BNE1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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Tcaf1Q8BNE1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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Tcaf1Q8BNE1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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Tcaf1Q8BNE1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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