Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKF1

Polrmt, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolrmtQ8BKF1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolrmtQ8BKF1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolrmtQ8BKF1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolrmtQ8BKF1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PolrmtQ8BKF1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PolrmtQ8BKF1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PolrmtQ8BKF1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolrmtQ8BKF1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolrmtQ8BKF1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms