Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GopcQ8BH60 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms