Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmco3Q8BH01 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco3Q8BH01 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco3Q8BH01 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms