Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe23Q8BGW3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms