Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sv2bQ8BG39 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sv2bQ8BG39 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms