Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Necab1Q8BG18 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Necab1Q8BG18 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms