Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim19Q80ZU4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim19Q80ZU4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms