Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrsam1Q80ZI6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrsam1Q80ZI6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrsam1Q80ZI6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms