Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo1Q7TT28 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo1Q7TT28 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms