Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccp110Q7TSH4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccp110Q7TSH4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccp110Q7TSH4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 499.4 ms