Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn1Q7TPR4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms