Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GypcQ78HU7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GypcQ78HU7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms