Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d2Q6PHS9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna2d2Q6PHS9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms