Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc57Q6PHN1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms