Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HjurpQ6PG16 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HjurpQ6PG16 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HjurpQ6PG16 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms