Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3bQ6NWW9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fndc3bQ6NWW9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3bQ6NWW9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms