Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt87Q6IMF0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt87Q6IMF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt87Q6IMF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt87Q6IMF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt87Q6IMF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt87Q6IMF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt87Q6IMF0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt87Q6IMF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt87Q6IMF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt87Q6IMF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms