Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt39Q6IFX4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt39Q6IFX4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt39Q6IFX4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms