Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msl2Q69ZF8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Msl2Q69ZF8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Msl2Q69ZF8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msl2Q69ZF8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Msl2Q69ZF8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms