Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrcc1Q69ZB0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrcc1Q69ZB0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms