Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna3Q65CL1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna3Q65CL1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms