Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nptx1Q62443 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx1Q62443 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms