Protein–RNA interactions for Protein: Q62415

Ppp1r13b, Apoptosis-stimulating of p53 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r13bQ62415 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r13bQ62415 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r13bQ62415 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r13bQ62415 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms