Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema4bQ62179 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms