Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprrQ62132 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprrQ62132 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms