Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EsrrbQ61539 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EsrrbQ61539 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms