Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccne1Q61457 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccne1Q61457 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms