Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PcolceQ61398 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcolceQ61398 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms