Protein–RNA interactions for Protein: Q61093

Cybb, Cytochrome b-245 heavy chain, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CybbQ61093 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CybbQ61093 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CybbQ61093 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CybbQ61093 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CybbQ61093 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CybbQ61093 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CybbQ61093 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CybbQ61093 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CybbQ61093 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CybbQ61093 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CybbQ61093 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms