Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Meis1Q60954 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Meis1Q60954 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms