Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnot7Q60809 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot7Q60809 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms