Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms