Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Satb1Q60611 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Satb1Q60611 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Satb1Q60611 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Satb1Q60611 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Satb1Q60611 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Satb1Q60611 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Satb1Q60611 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Satb1Q60611 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Satb1Q60611 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Satb1Q60611 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Satb1Q60611 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Satb1Q60611 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Satb1Q60611 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Satb1Q60611 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Satb1Q60611 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Satb1Q60611 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Satb1Q60611 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Satb1Q60611 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Satb1Q60611 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Satb1Q60611 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Satb1Q60611 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Satb1Q60611 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Satb1Q60611 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Satb1Q60611 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Satb1Q60611 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Satb1Q60611 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Satb1Q60611 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Satb1Q60611 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Satb1Q60611 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Satb1Q60611 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Satb1Q60611 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Satb1Q60611 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Satb1Q60611 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Satb1Q60611 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Satb1Q60611 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Satb1Q60611 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Satb1Q60611 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Satb1Q60611 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Satb1Q60611 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Satb1Q60611 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Satb1Q60611 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Satb1Q60611 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Satb1Q60611 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Satb1Q60611 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Satb1Q60611 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms