Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cxcl17Q5UW37 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Cxcl17Q5UW37 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Cxcl17Q5UW37 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl17Q5UW37 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcl17Q5UW37 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms