Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r223Q5SSA0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r223Q5SSA0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r223Q5SSA0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r223Q5SSA0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r223Q5SSA0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r223Q5SSA0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r223Q5SSA0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r223Q5SSA0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r223Q5SSA0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r223Q5SSA0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms