Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930512M02RikQ5SQK8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930512M02RikQ5SQK8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms