Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PkdccQ5RJI4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms