Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtp3Q5QGU6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtp3Q5QGU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms