Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NEXMIFQ5QGS0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEXMIFQ5QGS0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEXMIFQ5QGS0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms