Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsrp1Q5NCR9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nsrp1Q5NCR9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms