Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtmr11Q3V1L6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtmr11Q3V1L6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms