Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd42Q3V096 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd42Q3V096 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd42Q3V096 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd42Q3V096 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd42Q3V096 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd42Q3V096 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd42Q3V096 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd42Q3V096 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd42Q3V096 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd42Q3V096 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd42Q3V096 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms