Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog7Q3UM29 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog7Q3UM29 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog7Q3UM29 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms