Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E330014E10RikQ3UL33 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E330014E10RikQ3UL33 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms